Junior最初由于健康原因在Yuri Calton的指导下练习巴西柔术，之后开始进行综合格斗训练，同时他遇到了他的拳击教练Dorea，大约一年后，他进行了首场比赛。他的职业生涯始于2006年，当时他21岁，参加的是巴西的小型赛事，例如Demo Fight、Extreme Fighting Championship、Minotauro Fights 和 Mo Team League。他连续获得了前6场胜利，但是第7场他负于Joaquim Ferreira，被对手降服（这是二人的二番战，Santos曾战胜过Joaquim Ferreira），这也是他迄今为止唯一的一场失利。
加入UFC
Santos的UFC处子秀是在UFC90。当时他被认为处于明显劣势，但是他在第一回合就以一记沉重的升龙拳KO了顶级巴柔高手 Fabricio Werdum。在UFC95，他又在第一回合TKO了Stefan Struve。在UFC103，他获得了他最大的胜利之一，战胜了Mirko Filipovic（“战警”） 。在UFC108，原定他对战Gabriel Gonzaga，但Gabriel Gonzaga因病退出，取而代之，Santos对战 Gilbert Yvel（“飓风”），并且第一回合TKO对手。之后他对阵Gabriel Gonzaga，并在第一回合KO对手。在UFC117（2010.8.7），他面对Roy Nelson（“大乡村”），在这场比赛中，Santos使用了多种格斗技巧，并且第一次成功takedown对手。尽管Santos的打击能力很强，但是Nelson还是坚持到了最后，最终判定Santos胜利。受到肩伤及手术的困扰，重量级冠军Cain Velasquez在一段时间无法比赛，所以冠军战一直被搁置。原本计划2011.6.11，UFC131，Santos对阵前UFC重量级冠军Brock Lesnar（负于Cain Velasquez，失去冠军头衔），但是由于Lesnar受到严重疾病的困扰，改由Shane Carwin（一回合之王，曾经挑战Lesnar，并在第一回合险些取胜，最终在第二回合被Lesnar降服，挑战失败）对阵Santos。在比赛中，Santos控制着局面，在第一回合重创了Carwin的面部，最后3回合比赛结束，一致判定Santos胜，虽然他仍然主要依赖于他的拳击技巧，但是这次却展现了多种格斗技，例如两次踢击，和两次takedown。现在他无可争议成为UFC冠军Cain Velasquez的挑战者，二人于2011.11.19角逐冠军。
成为UFC重量级冠军
Santos在11.12对阵Cain Velasquez，这也是福克斯电视台首次直播UFC赛事。比赛进行到第一回合1分04秒的时候，Santos 以一记精准的右手摆拳KO击败了Cain，至此，他赢得了UFC重量级冠军头衔。但在比赛中他膝盖受伤，不久后需要接受手术治疗。未来，他将对阵UFC141的胜者Alistair Overeem（“毁灭者“，在ufc141第一回合TKO Brock Lesnar，随后Lesnar宣布退役，Overeem是现任Strikeforce的重量级冠军，K1-GP冠军，日本Dream现任重量级冠军，三料冠军）来捍卫冠军头衔。
UFC146 卫冕成功
UFC146的冠军争夺赛一波三折，最终，前UFC冠军FRANK MIR站在了DOS SANTOS面前，成为DOS SANTOS卫冕的第一战。这二位过往没有任何交集，也谈不上过节，但MIR曾经第一个将不倒的牛头人打倒，也曾将从未被降服的牛头人降服，这就同JSD产生了因果，要知道，JSD的格斗生涯，正始于牛头人的慧眼识英雄。而作为回报，JDS在上一场比赛KO了曾经将牛头人重重打倒的Cain Velasquez，为自己的导师完美复仇，而今，JDS再一次为自己的导师复仇成功。比赛从FRANK MIR的一记TAKE DOWN开始，总所周知，JDS的拳头犀利，而相应的，JDS似乎从未在地战中有所建树；MIR的战术固然丑陋，却很好的规避了诸多风险，只是他似乎忘记了，JDS从来不会让自己轻易被放倒。在首次TAKE DOWN无效之后，从某种程度上来说，JDS已经过了第一关的考验。双方从缠斗切换入立技模式的时候，似乎JDS并未找到行之有效的打击方法，并且MIR那大了一圈的体格给予JDS一些压迫感。在第一回合前一半的时间内，双方都没有什么建树，但MIR却有几次惊人之举，当然，JDS也用拳头给予沉重的回击，并且JDS似乎并不着急要结束比赛，在这种诡异的氛围中，比赛的节奏一点点的开始朝着JDS所熟悉的状态转变，这尤其让人觉得恐怖，因为这种引领比赛节奏的做法，之前有一个巴西人玩到了淋漓尽致，那个人，就是如今已经成为神一般的ANDERSON SILVA。进攻的号角始于第一回合的最后那一段时间，MIR在经历了几次成功的拳法试探之后，似乎有了头脑发热的症状，这对于这位在UFC征战多年的老将来说明显不是什么好事儿，此前的多次比赛正是因为头脑发热才让这位本来已经前途一片大好的前王者再度蒙尘，然而让MIR头脑冷静下来的，却是DOS SANTOS的拳头。在第一回合还剩下最后十几秒的时候，JDS忽然如泰森附体一样，开始了一次极为成功的组合拳连击，MIR在这种攻击波下，只能抱头鼠窜，可以说，MIR是被铃声给救了一命，当然，如果JDS能早个三十秒发动，那估计第二回合也不会继续了。第二回合一开始，Junior dos Santos就已经冲着镜头开始微笑，这正是一位王者的信心的体现。从第二回合一开始，JDS就让MIR吃尽了苦头，而真正奠定胜局的，正是MIR的一次看似成功的膝打，本来精确命中对手躯干的膝打可以取得良好的效果，但JDS却一记直拳让MIR应声倒地，之后JDS的地面锤击也很小心，没有给MIR任何关节技翻盘比赛的可能，MIR被锤至比赛的最后一刻，JDS都没有给MIR任何一丝哪怕是推迟比赛终结的可能。比赛被JDS完美的把控了。自从去年之后，首次卫冕的JDS还有不少问题需要解决，UFC的扩张让很多欧洲强人降临UFC，但相应的，JDS每一次的卫冕，都将含金量十足，在用MIR小试牛刀之后，接下来的，才是真正令人期待的大战。